(一)马拉松路线(42.195公里)
南京奥林匹克体育中心东门(起点)—江东中路(逆行)(右转)—梦都大街(顺行)(左转)—凤台南路(顺行)(右转)—应天大街(顺行)(左转)—雨花路(全幅)(右转)—东干长巷(全幅)(左转)—中华路(全幅)(左转)—白下路(全幅)(右转)—中山路(顺行)(右转)—长江路(全幅)(直行)—汉府街(全幅)(左转)—龙蟠中路(逆行,过珠江路路口后顺行)(右转)—龙蟠路(顺行,过太平路路口后逆行)(左转)—玄武湖公园绿道—玄武门—神武路(全幅)(左转)—板井巷(全幅)(左转)—中央路(顺行)(右转)—模范马路(顺行)(右转)—淮滨路(全幅)(右转)—江边南路(全幅)(直行)—江边路(全幅)(左转)—宝塔桥四街(全幅,过长江大桥下后逆行)(右转)—象山路(逆行)(左转)—燕江路(逆行)(直行)—永济大道(逆行,路中绿化带结束后,全幅)(右转)—和燕路(全幅)(左转)—燕津大道(全幅)(右转)—燕南路(顺行,折返处折返)—燕南路(顺行)(右转)—燕津大道(全幅)—燕子矶滨江公园(终点)
(二)迷你健康跑路线(约5公里)
南京奥林匹克体育中心东门(起点)-江东中路(逆行)(左转)-梦都大街(逆行)(左转)江苏大剧院北门(左转)-江苏大剧院东环路(全幅)-江苏大剧院南门(左转)-奥体大街(逆行)(左转)-江东中路(逆行)-南京奥林匹克体育中心东门(终点)